Сюжет сериала разворачивается в небольшом шахтерском городке на Урале, который в советские времена был закрыт из-за добычи урана. В настоящее время город немного открылся, но, тем не менее, сюда почти никто не приезжает, кроме местных жителей. Как и в любом маленьком населённом пункте, жизни его обитателей переплетены друг с другом, а старинные здания хранят множество тайн. Географически город также изолирован: с одной стороны его окружают горы, а с другой – река. Единственное сообщение осуществляется через мост.
Главный герой, Леша, возвращается домой после службы в специальных войсках. С момента его отъезда родной город изменился несущественно, создается впечатление, что здесь не происходит ничего нового. Однако в день его прибытия случается ужасная авария на шахте, после которой в городе начинаются странные природные явления, ставящие местных жителей в рискованные ситуации. Небо затягивается тучами, усиливаются грозы без дождя, и над городом нависает густой туман.
Когда жители, наконец, справляются с этими трудностями, они осознают, что оказались в полной изоляции. Мост перекрыт военными, а берега реки оцеплены. Солдаты находятся в защитной одежде, и единственное слово, которое удается узнать горожанам, – это «Карантин». В ответ на эту ситуацию жители города выдвигают властям ультиматум: «С кем вы находитесь? С нами или с «ними»? Вы всё еще власть, или вы одна из нас, и мы вместе противостоим тому, что происходит?»